Poslaním akadémie OBSE v Biškeku je podporovať regionálnu spoluprácu, predchádzanie konfliktom a dobrú správu vecí verejných v Strednej Ázii prostredníctvom postgraduálneho vzdelávania, odborných školení a intelektuálnej výmeny. Akadémia plní svoje poslanie prostredníctvom konkrétnych aktivít vrátane:
Poskytovanie odbornej prípravy a vzdelávania v oblasti ľudských práv, rozvoja médií, predchádzania konfliktom, riadenia, riešenia, obnovy po konflikte a v oblasti ekonomiky, riadenia a rozvoja;
Vykonávanie dopytu orientovaného a praktického výskumu relevantných stredoázijských tém zameraných na budovanie miestnej, národnej a regionálnej bezpečnosti;
Podpora výmeny informácií a vedeckej spolupráce medzi stredoázijskými akademickými inštitúciami a ich medzinárodnými partnerskými organizáciami;
Vytvorenie a rozvoj regionálnej siete odborníkov a výskumných pracovníkov.